Los fondos son invertidos siguiendo directrices distintas, compatibles con sus respectivos objetivos.
El FRP se invierte actualmente en instrumentos de deuda emitidos por gobiernos de países y de otras entidades relacionadas como, por ejemplo, multilaterales, municipalidades, empresas estatales, entre otros, que en su conjunto representan el 65% de fondo; en instrumentos de deuda emitidos por corporaciones (20% del fondo); y en acciones de empresas (15% del fondo). Los instrumentos de deuda deben tener grado de inversión y solamente se puede invertir en los instrumentos que se encuentran en el comparador referencial. La composición del portafolio de inversión del FRP será gradualmente ajustada según la nueva política de inversión aprobada en noviembre de 2017, a partir de las recomendaciones del Comité Financiero. La nueva composición estratégica se compone en 23% de bonos soberanos y activos relacionados, 5% en bonos indizados a inflación, 13% en bonos corporativos, 40% en acciones, 6% en MBS de agencias de EE.UU., 8% bonos de alto rendimiento, 5% en mercado inmobiliario.
Según la política de inversión actual, el FEES se invierte principalmente en renta fija (92,5%). Específicamente, la composición estratégica de activos establece que 77,5% de su portafolio se debe invertir en instrumentos de deuda emitidos por EE.UU., Alemania, Japón, y Suiza, 15% en depósitos a plazo con clasificación de riesgo superior o igual a A-, y el saldo, 7,5%, en acciones.